Pabellón primer ciclo
Construcción con gran luminosidad y que invita al encuentro de alumnos, profesores y asistentes de la Educación. Alberga a los alumnos de primer ciclo, inspectoría, pastoral y oficina de psicóloga. Está situado en el centro del plano del Liceo al costado de la capilla y comedor.
Pabellón de Segundo Ciclo
Corresponde a la primera construcción realizada en el nuevo local y alberga a los alumnos más grandes de la E. Básica, cuenta con las salas respectivas, baños y oficina de inspectoría General. En el frontis existe un hermoso jardín que sirve de lugar de encuentro y recreación para alumnos, apoderados y Asistentes de la Educación.
Edificio de apoyo pedagógico
En esta amplia y sólida construcción están alojados aquellos servicios imprescindibles para el desarrollo de actividades pedagógicas y académicas. En primer lugar reside la atención diferencial para aquellos alumnos que poseen necesidades educativas especiales. Además está la oficina de Unidad Técnico Pedagógica que atiende las necesidades de alumnos y profesores desde el nivel Parvulario hasta E Media. Por último se encuentra la biblioteca C.R.A de Enseñanza Básica que posee dos secciones: la primera para préstamos de textos y sala de lectura y la segunda que contempla una espaciosa sala de estudio.
Pabellón de Enseñanza Media
Corresponde a la última construcción realizada en el Liceo entre los años 2013 y 2014. El año de inauguración corresponde a este último año y representa uno de los grandes anhelos de la Comunidad Educativa SS.CC de San Javier, debido a que por fin se logó unir en un mismo lugar físico a todos sus integrantes. Este pabellón cuenta con: salas de primero a cuarto de E Media, Sala de computación, inspectoría, oficina de Orientación, baños y biblioteca C.R.A.
Sala de computación de enseñanza básica
Los alumnos de enseñanza básica disponen de una sala con un moderno equipamiento computacional con Computadores para un curso completo, internet en todos los computadores, scaner e impresora para que puedan realizar sus tareas y trabajos en el liceo.
Sala de computación de enseñanza media
También los alumnos de enseñanza media disponen del mismo equipamiento computacional, internet en todos los computadores, scaner e impresora para que puedan realizar sus actividades escolares